Qui sommes-nous ?

La cellule de bioinformatique O·D·I·L (Omics Data Integration & visuaLisation) a pour but d’accompagner les membres du BRIC dans leur projet impliquant des expertises en bioinformatique suivant la stratégie présentée au travers de nos missions décrites dans la section éponyme.

Comité exécutif

• Responsable Scientifique : Elodie Darbo
• Cyril Dourthe

Comité Utilisateurs·trices expert·e·s

• Anne-Aurélie Raymond
• Anne Persoz
• Samuel Amintas
• Audrey Gros
• Jessica Massière

Organigramme et logigramme

Nos missions

• Consolider le lien avec l’ axe Santé-Numérique du Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique (LaBRI) par le co-encadrement de Master/Doctorant·e/Post-Doc et par l’organisation de rencontres LaBRIC entre les deux unités. Voir: Qu’est-ce que le LaBRIC ?
• Encadrement de stagiaires en bioinformatique (M1/M2) et d’ingénieur·e·s (IE). Voir Encadrements passés et en cours
• Accompagnement pour la réponse à des appels à projets
• Développement d’outils interfacés et mise à disposition des chercheurs pour l’exploration et la visualisation de résultats
• Mise en place progressive d’une base de données interne au BRIC
• Formation à l’utilisation d’outils
• Faire remonter les besoins des équipes pour aider à l’amélioration des outils (ex : ajout de fonctionnalités) ou pour la création de nouveaux outils grâce à des réunions régulières entre utilisteurs et concepteurs.

Bac à sable

Nous mettons à disposition aux membres du BRIC une boite à idées dans laquelle vous pourrez y déposer vos idées concernant la visualisation de vos résultats. Un modèle y est d’ailleurs disponible.
L’idée est de pouvoir identifier au sein de notre unité les compétences déjà présentes et de faciliter leurs échanges et transferts.

Recensement des compétences

Nous mettons à disposition un tableur où chacun est libre de s’y ajouter pour y faire apparaitre des compétences de tout niveau en bioinformatique. Cela peut concerner à la fois la maitrise de bases données ou d’outils en ligne, la montée en compétence d’analyse de données spécifiques (RNA-seq, CHIP-seq, single cell, protéomique spatiale etc.).

Evénements

Save the date : La cellule est en train d’organniser la seconde matinée de rencontre entre le BRIC et le LaBRIC qui aura lieu le Mercredi 29 Mai de 9h30 à 12h à l’amphithéatre du BBS. Nous prévoyons une pause café et un buffet/cocktail afin de nous permettre d’échanger.

Programme à venir …

Nous joindre

Contact : elodie.darbo@u-bordeaux.fr